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Datenqualität

  • 346 von 474 geparsten Analyten bekommen keine LOINC-Zuordnung und werden nicht ausgeliefert (Problem-Report von scripts/parse_lab_values.py, Abschnitt no LOINC match). Größte Gruppen: Medikamentenspiegel ((therapeutic)-Suffix), Hormone mit Zyklusphasen/Geschlecht als Unterzeilen, Zellzählungen (μL−1), Immunglobuline, Vitamine. Weg: Suffixe wie (therapeutic) vor dem Matching abstreifen, Unterzeilen-Namen normalisieren, dann gezielt in manual_loinc_mapping.json pinnen.

  • 37 traditionelle Einheiten ohne PROPERTY-Mapping (μL−1, mm Hg, s, pg/cell, g Hb/dL, mL/min/1.73 m2, …) — für sie greift kein Property-Filter. _UNIT_PROPERTIES erweitern, sobald Analyte mit diesen Einheiten ausgeliefert werden sollen.

  • Fuzzy-Matches im Problem-Report einmal komplett gegenprüfen (aktuell 20, alle ≥ 82 %). Gegengeprüft und dokumentiert: Acetylcholinesterase, LDH, Hb-Fraktionen (siehe docs/data.md).

  • Faktor-Check meldet Methionin und Tyrosin — Rundung in der Quelle (6.71 → 6, 22.08 → 20), kein Fehler. Ggf. Toleranz für einstellige SI-Werte lockern, damit der Report leer bleibt.

Code-Qualität

  • _resolve_analyte_identifier in converters.py: Abbreviation-Lookup hat noch keine Daten. Der Reverse-Index _abbrev_index bleibt leer, solange abbreviation-Felder in analytes.json fehlen. Entweder LOINC SHORTNAME/CONSUMER_NAME einspielen oder den Zweig entfernen.

  • loinc_num ist in jedem Entry und im Outer-Key. Redundant; beim nächsten Format-Bump raus.

  • scripts/models.py: subtitle und gender sind ungenutzt.

  • docs/design.md, Abschnitt „conversion_factor stored as string“ ist veraltet — der Faktor ist seit Remove support for null conversion_factor ein float.

Format

  • analytes.json mit indent=2. Gut für Diffs; bei > 1000 Einträgen indent=None erwägen.

  • ~30 Einträge haben conversion_factor == 1.0 (traditionelle Einheit == SI-Einheit). Korrekt, aber reines Unit-Lookup ohne Umrechnungs-Mehrwert.

Erledigt

  • Öffentliche Iteration über alle Analyte — analytes() in converters.py, liefert Analyte-Records (LOINC, Name, Specimen, Einheiten, Faktor); siehe docs/api.md.
  • SI-Referenzintervall für Konsumenten — Entscheidung: bleibt draußen (MDR); Konsumenten beziehen Referenzwerte aus ihrer eigenen, laborspezifischen Quelle. Begründung in docs/design.md.
  • LOINC-Zuordnung ohne Specimen/Property/Scale — Matcher filtert jetzt nach SYSTEM, PROPERTY, SCALE_TYP, CLASS, STATUS; Tie-Break über COMMON_TEST_RANK.
  • Stille Kollisionen beim Schreiben von analytes.json — Pipeline bricht bei zwei verschiedenen Zeilen auf einem LOINC ab.
  • Kein Audit-Trail für Fuzzy-Matches — Problem-Report listet Fuzzy-Treffer mit Score, Pins, Korrekturen und Faktor-Inkonsistenzen.
  • Referenzintervalle in der Auslieferung — entfernt; Zweckbestimmung in README/docs.
  • Loinc.csv / AccessMedicine-HTML im Repo — aus Tracking und History entfernt, gitignored.